Problem mit subdomain und path

Als ich angefangen habe meine Drupal 6.x Seite aufzubauen, habe ich Drupal in einen Unterordner meiner Domain installiert (http://beispiel.de/drupal). Bei einigen Seiten habe ich über das Path Modul die Pfade angepasst, was auch problemlos funktioniert hat.

Danach habe ich eine Subdomain angelegt, die auf den Ordner zeigt.
Also: http://subdomain.beispiel.de/ zeigt auf http://beispiel.de/drupal.
Jetzt funktionieren nur noch Links wie: http://subdomain.example.com/bla.htm, aber nicht mehr Links wie http://subdomain.example.com/blub/bla.htm.
Mit Firefox bekomme ich auf diesen Links die Fehlermeldung: "The page isn't redirecting properly", d.h. aus irgendeinem Grund gerät der Server in eine Redirect Schleife.

In settings.php habe ich die base_dir auf http://subdomain.example.com gesetzt und in .htaccess "RewriteBase /" gesetzt.

Was mache ich falsch?

Update: Das Problem hat sich erledigt. Es war das Permalink Modul.